Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNTN1Q12860 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNTN1Q12860 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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