Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

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Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
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KCNMA1Q12791 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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KCNMA1Q12791 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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KCNMA1Q12791 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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KCNMA1Q12791 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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KCNMA1Q12791 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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KCNMA1Q12791 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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KCNMA1Q12791 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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KCNMA1Q12791 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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KCNMA1Q12791 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMA1Q12791 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
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