Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFFO1Q0D2I5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IFFO1Q0D2I5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms