Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms