Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP1Q04837 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP1Q04837 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms