Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC4Q03721 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms