Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4A11Q02928 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CYP4A11Q02928 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP4A11Q02928 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms