Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUCB1Q02818 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUCB1Q02818 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms