Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms