Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IFITM3Q01628 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms