Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms