Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms