Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CBX1P83916 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CBX1P83916 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CBX1P83916 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CBX1P83916 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CBX1P83916 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CBX1P83916 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CBX1P83916 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CBX1P83916 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBX1P83916 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBX1P83916 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBX1P83916 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBX1P83916 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBX1P83916 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBX1P83916 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBX1P83916 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CBX1P83916 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBX1P83916 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBX1P83916 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CBX1P83916 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBX1P83916 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CBX1P83916 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX1P83916 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX1P83916 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX1P83916 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX1P83916 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX1P83916 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX1P83916 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX1P83916 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX1P83916 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX1P83916 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX1P83916 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX1P83916 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX1P83916 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX1P83916 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX1P83916 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX1P83916 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX1P83916 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX1P83916 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX1P83916 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX1P83916 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX1P83916 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX1P83916 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX1P83916 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CBX1P83916 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX1P83916 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX1P83916 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX1P83916 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX1P83916 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX1P83916 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX1P83916 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX1P83916 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX1P83916 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX1P83916 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX1P83916 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX1P83916 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX1P83916 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX1P83916 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX1P83916 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX1P83916 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX1P83916 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX1P83916 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CBX1P83916 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX1P83916 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX1P83916 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX1P83916 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX1P83916 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX1P83916 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX1P83916 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX1P83916 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX1P83916 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX1P83916 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX1P83916 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX1P83916 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX1P83916 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX1P83916 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX1P83916 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX1P83916 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX1P83916 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX1P83916 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX1P83916 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX1P83916 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX1P83916 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX1P83916 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX1P83916 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX1P83916 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CBX1P83916 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX1P83916 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX1P83916 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX1P83916 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX1P83916 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX1P83916 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX1P83916 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX1P83916 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX1P83916 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX1P83916 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX1P83916 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX1P83916 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX1P83916 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CBX1P83916 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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