Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IP78347 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms