Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11AP62491 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms