Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTXN1P60606 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTXN1P60606 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms