Protein–RNA interactions for Protein: P59646

FXYD4, FXYD domain-containing ion transport regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD4P59646 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXYD4P59646 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms