Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CABP4P57796 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CABP4P57796 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CABP4P57796 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CABP4P57796 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CABP4P57796 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CABP4P57796 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CABP4P57796 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CABP4P57796 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CABP4P57796 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CABP4P57796 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CABP4P57796 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CABP4P57796 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CABP4P57796 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CABP4P57796 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CABP4P57796 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CABP4P57796 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CABP4P57796 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CABP4P57796 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CABP4P57796 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CABP4P57796 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CABP4P57796 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CABP4P57796 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CABP4P57796 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CABP4P57796 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CABP4P57796 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CABP4P57796 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CABP4P57796 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CABP4P57796 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CABP4P57796 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CABP4P57796 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CABP4P57796 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CABP4P57796 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CABP4P57796 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CABP4P57796 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CABP4P57796 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CABP4P57796 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CABP4P57796 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CABP4P57796 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CABP4P57796 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CABP4P57796 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CABP4P57796 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CABP4P57796 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CABP4P57796 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CABP4P57796 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CABP4P57796 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CABP4P57796 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CABP4P57796 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CABP4P57796 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CABP4P57796 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CABP4P57796 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CABP4P57796 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CABP4P57796 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CABP4P57796 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CABP4P57796 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CABP4P57796 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CABP4P57796 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CABP4P57796 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CABP4P57796 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CABP4P57796 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CABP4P57796 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CABP4P57796 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CABP4P57796 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CABP4P57796 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CABP4P57796 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CABP4P57796 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CABP4P57796 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CABP4P57796 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CABP4P57796 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CABP4P57796 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CABP4P57796 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CABP4P57796 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CABP4P57796 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CABP4P57796 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CABP4P57796 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CABP4P57796 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CABP4P57796 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CABP4P57796 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CABP4P57796 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CABP4P57796 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CABP4P57796 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CABP4P57796 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CABP4P57796 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CABP4P57796 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CABP4P57796 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CABP4P57796 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CABP4P57796 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CABP4P57796 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CABP4P57796 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CABP4P57796 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CABP4P57796 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CABP4P57796 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CABP4P57796 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CABP4P57796 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CABP4P57796 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CABP4P57796 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CABP4P57796 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CABP4P57796 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CABP4P57796 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CABP4P57796 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms