Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA9P57773 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA9P57773 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA9P57773 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA9P57773 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA9P57773 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA9P57773 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA9P57773 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA9P57773 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA9P57773 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA9P57773 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA9P57773 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA9P57773 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA9P57773 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA9P57773 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJA9P57773 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJA9P57773 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJA9P57773 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJA9P57773 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJA9P57773 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJA9P57773 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA9P57773 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA9P57773 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA9P57773 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA9P57773 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA9P57773 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA9P57773 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA9P57773 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA9P57773 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA9P57773 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA9P57773 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA9P57773 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA9P57773 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA9P57773 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA9P57773 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA9P57773 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA9P57773 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA9P57773 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA9P57773 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA9P57773 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA9P57773 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA9P57773 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA9P57773 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA9P57773 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA9P57773 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA9P57773 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA9P57773 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA9P57773 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA9P57773 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA9P57773 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA9P57773 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA9P57773 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA9P57773 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA9P57773 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA9P57773 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA9P57773 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA9P57773 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA9P57773 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA9P57773 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA9P57773 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA9P57773 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA9P57773 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA9P57773 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA9P57773 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA9P57773 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA9P57773 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA9P57773 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms