Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP1P56182 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP1P56182 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP1P56182 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP1P56182 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP1P56182 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP1P56182 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP1P56182 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP1P56182 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP1P56182 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP1P56182 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP1P56182 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP1P56182 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP1P56182 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP1P56182 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP1P56182 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP1P56182 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP1P56182 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP1P56182 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP1P56182 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP1P56182 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP1P56182 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP1P56182 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP1P56182 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP1P56182 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP1P56182 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP1P56182 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP1P56182 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP1P56182 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP1P56182 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP1P56182 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP1P56182 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP1P56182 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP1P56182 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP1P56182 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP1P56182 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP1P56182 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP1P56182 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP1P56182 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP1P56182 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP1P56182 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP1P56182 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP1P56182 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP1P56182 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP1P56182 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP1P56182 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP1P56182 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP1P56182 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP1P56182 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP1P56182 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP1P56182 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP1P56182 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP1P56182 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP1P56182 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP1P56182 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP1P56182 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP1P56182 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP1P56182 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP1P56182 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP1P56182 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP1P56182 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP1P56182 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP1P56182 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP1P56182 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP1P56182 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP1P56182 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP1P56182 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP1P56182 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP1P56182 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRP1P56182 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRP1P56182 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRP1P56182 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRP1P56182 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRP1P56182 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RRP1P56182 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRP1P56182 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RRP1P56182 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RRP1P56182 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RRP1P56182 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRP1P56182 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RRP1P56182 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRP1P56182 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRP1P56182 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RRP1P56182 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RRP1P56182 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRP1P56182 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RRP1P56182 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRP1P56182 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RRP1P56182 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRP1P56182 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRP1P56182 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRP1P56182 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RRP1P56182 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RRP1P56182 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRP1P56182 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRP1P56182 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRP1P56182 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRP1P56182 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRP1P56182 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRP1P56182 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms