Protein–RNA interactions for Protein: P55075

FGF8, Fibroblast growth factor 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF8P55075 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGF8P55075 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FGF8P55075 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGF8P55075 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGF8P55075 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGF8P55075 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGF8P55075 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FGF8P55075 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGF8P55075 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGF8P55075 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
FGF8P55075 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FGF8P55075 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF8P55075 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms