Protein–RNA interactions for Protein: P52815

MRPL12, 39S ribosomal protein L12, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL12P52815 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPL12P52815 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL12P52815 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms