Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA3P52797 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms