Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP5P51878 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP5P51878 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP5P51878 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP5P51878 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP5P51878 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP5P51878 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP5P51878 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP5P51878 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP5P51878 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP5P51878 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP5P51878 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP5P51878 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP5P51878 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP5P51878 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP5P51878 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP5P51878 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP5P51878 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP5P51878 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP5P51878 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP5P51878 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP5P51878 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP5P51878 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP5P51878 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP5P51878 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP5P51878 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP5P51878 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP5P51878 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP5P51878 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP5P51878 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP5P51878 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP5P51878 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP5P51878 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP5P51878 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP5P51878 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP5P51878 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP5P51878 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP5P51878 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP5P51878 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP5P51878 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP5P51878 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP5P51878 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP5P51878 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP5P51878 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP5P51878 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP5P51878 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP5P51878 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP5P51878 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP5P51878 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP5P51878 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP5P51878 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP5P51878 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP5P51878 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP5P51878 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP5P51878 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP5P51878 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP5P51878 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP5P51878 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP5P51878 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP5P51878 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP5P51878 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP5P51878 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP5P51878 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP5P51878 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP5P51878 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP5P51878 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP5P51878 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP5P51878 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP5P51878 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP5P51878 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP5P51878 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP5P51878 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP5P51878 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP5P51878 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP5P51878 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP5P51878 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP5P51878 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP5P51878 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP5P51878 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP5P51878 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP5P51878 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP5P51878 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP5P51878 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP5P51878 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP5P51878 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP5P51878 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP5P51878 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP5P51878 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP5P51878 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP5P51878 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP5P51878 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP5P51878 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP5P51878 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP5P51878 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP5P51878 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP5P51878 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP5P51878 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP5P51878 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP5P51878 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP5P51878 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms