Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTPAP49638 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTPAP49638 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTPAP49638 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTPAP49638 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTPAP49638 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TTPAP49638 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TTPAP49638 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TTPAP49638 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TTPAP49638 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TTPAP49638 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TTPAP49638 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TTPAP49638 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TTPAP49638 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TTPAP49638 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TTPAP49638 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TTPAP49638 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TTPAP49638 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TTPAP49638 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TTPAP49638 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TTPAP49638 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TTPAP49638 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TTPAP49638 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TTPAP49638 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TTPAP49638 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TTPAP49638 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TTPAP49638 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TTPAP49638 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TTPAP49638 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TTPAP49638 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TTPAP49638 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TTPAP49638 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TTPAP49638 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTPAP49638 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTPAP49638 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTPAP49638 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTPAP49638 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTPAP49638 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTPAP49638 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTPAP49638 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTPAP49638 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTPAP49638 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTPAP49638 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTPAP49638 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTPAP49638 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTPAP49638 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTPAP49638 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTPAP49638 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTPAP49638 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTPAP49638 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTPAP49638 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTPAP49638 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTPAP49638 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TTPAP49638 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTPAP49638 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTPAP49638 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTPAP49638 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTPAP49638 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TTPAP49638 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTPAP49638 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TTPAP49638 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTPAP49638 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTPAP49638 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTPAP49638 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTPAP49638 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTPAP49638 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TTPAP49638 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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