Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
UTRNP46939 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UTRNP46939 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UTRNP46939 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UTRNP46939 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UTRNP46939 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UTRNP46939 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UTRNP46939 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UTRNP46939 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UTRNP46939 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UTRNP46939 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UTRNP46939 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UTRNP46939 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UTRNP46939 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UTRNP46939 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UTRNP46939 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UTRNP46939 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UTRNP46939 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UTRNP46939 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTRNP46939 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTRNP46939 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTRNP46939 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTRNP46939 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTRNP46939 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTRNP46939 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTRNP46939 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTRNP46939 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTRNP46939 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTRNP46939 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UTRNP46939 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTRNP46939 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTRNP46939 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTRNP46939 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTRNP46939 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UTRNP46939 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UTRNP46939 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTRNP46939 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTRNP46939 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTRNP46939 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTRNP46939 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTRNP46939 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTRNP46939 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTRNP46939 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UTRNP46939 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTRNP46939 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTRNP46939 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTRNP46939 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTRNP46939 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTRNP46939 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTRNP46939 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTRNP46939 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTRNP46939 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTRNP46939 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTRNP46939 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTRNP46939 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTRNP46939 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTRNP46939 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTRNP46939 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTRNP46939 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UTRNP46939 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UTRNP46939 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UTRNP46939 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UTRNP46939 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UTRNP46939 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UTRNP46939 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UTRNP46939 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UTRNP46939 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UTRNP46939 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UTRNP46939 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UTRNP46939 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UTRNP46939 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UTRNP46939 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UTRNP46939 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UTRNP46939 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UTRNP46939 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UTRNP46939 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UTRNP46939 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UTRNP46939 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UTRNP46939 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
UTRNP46939 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
UTRNP46939 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UTRNP46939 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UTRNP46939 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UTRNP46939 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UTRNP46939 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UTRNP46939 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UTRNP46939 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UTRNP46939 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UTRNP46939 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UTRNP46939 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UTRNP46939 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UTRNP46939 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UTRNP46939 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
UTRNP46939 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UTRNP46939 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UTRNP46939 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UTRNP46939 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UTRNP46939 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UTRNP46939 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UTRNP46939 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms