Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP5P45974 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP5P45974 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP5P45974 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP5P45974 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP5P45974 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP5P45974 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP5P45974 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP5P45974 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP5P45974 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP5P45974 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP5P45974 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP5P45974 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP5P45974 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP5P45974 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP5P45974 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP5P45974 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP5P45974 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP5P45974 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP5P45974 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP5P45974 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP5P45974 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP5P45974 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP5P45974 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP5P45974 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP5P45974 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP5P45974 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP5P45974 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP5P45974 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP5P45974 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP5P45974 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP5P45974 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP5P45974 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP5P45974 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP5P45974 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP5P45974 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP5P45974 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP5P45974 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP5P45974 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP5P45974 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP5P45974 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP5P45974 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP5P45974 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP5P45974 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP5P45974 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP5P45974 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP5P45974 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP5P45974 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP5P45974 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP5P45974 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP5P45974 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP5P45974 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP5P45974 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP5P45974 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP5P45974 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP5P45974 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP5P45974 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP5P45974 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP5P45974 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP5P45974 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP5P45974 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP5P45974 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP5P45974 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP5P45974 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP5P45974 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP5P45974 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP5P45974 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP5P45974 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP5P45974 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP5P45974 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms