Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms