Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT2P35908 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT2P35908 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT2P35908 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT2P35908 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT2P35908 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT2P35908 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT2P35908 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT2P35908 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT2P35908 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT2P35908 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT2P35908 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT2P35908 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT2P35908 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT2P35908 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT2P35908 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT2P35908 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT2P35908 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT2P35908 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT2P35908 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT2P35908 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT2P35908 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT2P35908 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT2P35908 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT2P35908 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT2P35908 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT2P35908 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT2P35908 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT2P35908 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT2P35908 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT2P35908 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT2P35908 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT2P35908 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT2P35908 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT2P35908 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT2P35908 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT2P35908 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT2P35908 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT2P35908 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT2P35908 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT2P35908 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT2P35908 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT2P35908 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT2P35908 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT2P35908 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT2P35908 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT2P35908 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT2P35908 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT2P35908 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT2P35908 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT2P35908 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT2P35908 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT2P35908 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT2P35908 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT2P35908 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT2P35908 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT2P35908 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT2P35908 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT2P35908 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT2P35908 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT2P35908 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT2P35908 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT2P35908 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT2P35908 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT2P35908 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT2P35908 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT2P35908 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT2P35908 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT2P35908 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT2P35908 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT2P35908 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT2P35908 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT2P35908 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT2P35908 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT2P35908 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT2P35908 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT2P35908 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT2P35908 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT2P35908 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT2P35908 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT2P35908 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT2P35908 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT2P35908 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT2P35908 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT2P35908 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT2P35908 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT2P35908 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT2P35908 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT2P35908 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT2P35908 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT2P35908 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT2P35908 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT2P35908 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT2P35908 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT2P35908 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT2P35908 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT2P35908 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT2P35908 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT2P35908 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT2P35908 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms