Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF4P34130 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF4P34130 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF4P34130 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF4P34130 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF4P34130 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF4P34130 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF4P34130 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF4P34130 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF4P34130 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF4P34130 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF4P34130 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF4P34130 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF4P34130 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF4P34130 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF4P34130 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF4P34130 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF4P34130 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF4P34130 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF4P34130 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF4P34130 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF4P34130 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF4P34130 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF4P34130 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NTF4P34130 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NTF4P34130 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NTF4P34130 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NTF4P34130 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NTF4P34130 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF4P34130 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF4P34130 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF4P34130 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF4P34130 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF4P34130 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF4P34130 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF4P34130 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF4P34130 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF4P34130 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF4P34130 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF4P34130 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF4P34130 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF4P34130 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF4P34130 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF4P34130 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF4P34130 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF4P34130 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF4P34130 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF4P34130 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF4P34130 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF4P34130 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF4P34130 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF4P34130 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF4P34130 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF4P34130 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF4P34130 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF4P34130 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NTF4P34130 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTF4P34130 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTF4P34130 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTF4P34130 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTF4P34130 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTF4P34130 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NTF4P34130 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTF4P34130 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTF4P34130 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTF4P34130 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTF4P34130 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTF4P34130 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms