Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCKARP32238 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCKARP32238 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCKARP32238 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCKARP32238 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCKARP32238 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCKARP32238 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCKARP32238 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCKARP32238 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCKARP32238 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCKARP32238 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCKARP32238 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCKARP32238 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCKARP32238 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCKARP32238 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCKARP32238 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCKARP32238 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCKARP32238 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCKARP32238 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCKARP32238 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCKARP32238 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCKARP32238 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCKARP32238 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCKARP32238 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCKARP32238 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCKARP32238 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCKARP32238 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCKARP32238 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCKARP32238 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCKARP32238 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCKARP32238 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCKARP32238 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCKARP32238 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCKARP32238 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCKARP32238 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCKARP32238 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCKARP32238 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCKARP32238 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCKARP32238 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCKARP32238 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCKARP32238 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCKARP32238 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCKARP32238 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCKARP32238 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCKARP32238 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCKARP32238 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCKARP32238 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCKARP32238 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCKARP32238 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCKARP32238 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCKARP32238 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCKARP32238 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCKARP32238 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCKARP32238 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCKARP32238 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCKARP32238 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCKARP32238 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCKARP32238 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCKARP32238 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCKARP32238 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCKARP32238 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCKARP32238 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCKARP32238 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCKARP32238 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCKARP32238 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCKARP32238 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms