Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms