Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMLP26374 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMLP26374 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMLP26374 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMLP26374 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMLP26374 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMLP26374 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMLP26374 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMLP26374 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMLP26374 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMLP26374 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMLP26374 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMLP26374 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMLP26374 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMLP26374 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMLP26374 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMLP26374 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMLP26374 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMLP26374 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMLP26374 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMLP26374 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMLP26374 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMLP26374 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMLP26374 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMLP26374 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMLP26374 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMLP26374 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMLP26374 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMLP26374 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMLP26374 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMLP26374 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMLP26374 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMLP26374 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMLP26374 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMLP26374 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMLP26374 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMLP26374 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMLP26374 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMLP26374 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMLP26374 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMLP26374 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMLP26374 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMLP26374 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMLP26374 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMLP26374 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMLP26374 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMLP26374 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMLP26374 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMLP26374 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMLP26374 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMLP26374 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMLP26374 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMLP26374 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMLP26374 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMLP26374 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMLP26374 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMLP26374 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMLP26374 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMLP26374 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMLP26374 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMLP26374 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMLP26374 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMLP26374 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMLP26374 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMLP26374 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMLP26374 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMLP26374 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMLP26374 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMLP26374 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMLP26374 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMLP26374 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMLP26374 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMLP26374 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMLP26374 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMLP26374 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMLP26374 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMLP26374 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMLP26374 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMLP26374 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMLP26374 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMLP26374 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMLP26374 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMLP26374 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMLP26374 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMLP26374 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMLP26374 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMLP26374 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMLP26374 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMLP26374 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMLP26374 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHMLP26374 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHMLP26374 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHMLP26374 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHMLP26374 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMLP26374 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMLP26374 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMLP26374 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMLP26374 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMLP26374 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMLP26374 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms