Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCP20941 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCP20941 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCP20941 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCP20941 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCP20941 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCP20941 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCP20941 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCP20941 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCP20941 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCP20941 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCP20941 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCP20941 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCP20941 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCP20941 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCP20941 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCP20941 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCP20941 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCP20941 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCP20941 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCP20941 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCP20941 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCP20941 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCP20941 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCP20941 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCP20941 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCP20941 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCP20941 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCP20941 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCP20941 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCP20941 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCP20941 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCP20941 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCP20941 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCP20941 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCP20941 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCP20941 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCP20941 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCP20941 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCP20941 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCP20941 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCP20941 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCP20941 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCP20941 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCP20941 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCP20941 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCP20941 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCP20941 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCP20941 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCP20941 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCP20941 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCP20941 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCP20941 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCP20941 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCP20941 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCP20941 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCP20941 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCP20941 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCP20941 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCP20941 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCP20941 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCP20941 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCP20941 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCP20941 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCP20941 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCP20941 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCP20941 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCP20941 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCP20941 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCP20941 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCP20941 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCP20941 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCP20941 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCP20941 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCP20941 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCP20941 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCP20941 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCP20941 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCP20941 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCP20941 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCP20941 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCP20941 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCP20941 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCP20941 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCP20941 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCP20941 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCP20941 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCP20941 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCP20941 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCP20941 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCP20941 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCP20941 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCP20941 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCP20941 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCP20941 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCP20941 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCP20941 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCP20941 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCP20941 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCP20941 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms