Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDSP20132 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDSP20132 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDSP20132 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDSP20132 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDSP20132 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDSP20132 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDSP20132 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDSP20132 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDSP20132 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDSP20132 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDSP20132 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDSP20132 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDSP20132 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDSP20132 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDSP20132 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDSP20132 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDSP20132 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDSP20132 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDSP20132 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDSP20132 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDSP20132 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDSP20132 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDSP20132 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDSP20132 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDSP20132 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDSP20132 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDSP20132 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDSP20132 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDSP20132 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDSP20132 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SDSP20132 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SDSP20132 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDSP20132 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDSP20132 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDSP20132 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDSP20132 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDSP20132 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDSP20132 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDSP20132 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SDSP20132 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDSP20132 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SDSP20132 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDSP20132 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDSP20132 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDSP20132 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SDSP20132 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDSP20132 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDSP20132 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDSP20132 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDSP20132 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDSP20132 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDSP20132 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SDSP20132 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDSP20132 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDSP20132 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDSP20132 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDSP20132 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDSP20132 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDSP20132 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SDSP20132 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDSP20132 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDSP20132 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDSP20132 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDSP20132 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDSP20132 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDSP20132 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDSP20132 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDSP20132 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDSP20132 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDSP20132 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDSP20132 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDSP20132 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SDSP20132 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SDSP20132 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDSP20132 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDSP20132 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDSP20132 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDSP20132 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDSP20132 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDSP20132 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SDSP20132 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDSP20132 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SDSP20132 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDSP20132 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDSP20132 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDSP20132 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDSP20132 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDSP20132 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDSP20132 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDSP20132 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDSP20132 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDSP20132 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDSP20132 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SDSP20132 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDSP20132 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDSP20132 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDSP20132 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDSP20132 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDSP20132 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms