Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIG1P18858 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LIG1P18858 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIG1P18858 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIG1P18858 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIG1P18858 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIG1P18858 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIG1P18858 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIG1P18858 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIG1P18858 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIG1P18858 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIG1P18858 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIG1P18858 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIG1P18858 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIG1P18858 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIG1P18858 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIG1P18858 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIG1P18858 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIG1P18858 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIG1P18858 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIG1P18858 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIG1P18858 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIG1P18858 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIG1P18858 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIG1P18858 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIG1P18858 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIG1P18858 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIG1P18858 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIG1P18858 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIG1P18858 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIG1P18858 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIG1P18858 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIG1P18858 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIG1P18858 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIG1P18858 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIG1P18858 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIG1P18858 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIG1P18858 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIG1P18858 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIG1P18858 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LIG1P18858 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIG1P18858 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIG1P18858 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIG1P18858 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIG1P18858 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIG1P18858 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIG1P18858 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIG1P18858 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIG1P18858 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIG1P18858 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIG1P18858 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIG1P18858 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIG1P18858 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIG1P18858 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIG1P18858 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIG1P18858 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIG1P18858 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIG1P18858 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIG1P18858 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIG1P18858 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIG1P18858 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIG1P18858 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIG1P18858 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIG1P18858 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIG1P18858 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIG1P18858 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIG1P18858 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIG1P18858 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIG1P18858 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIG1P18858 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIG1P18858 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIG1P18858 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIG1P18858 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIG1P18858 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LIG1P18858 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LIG1P18858 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIG1P18858 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIG1P18858 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LIG1P18858 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIG1P18858 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIG1P18858 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIG1P18858 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIG1P18858 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIG1P18858 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIG1P18858 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIG1P18858 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIG1P18858 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIG1P18858 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIG1P18858 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIG1P18858 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIG1P18858 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIG1P18858 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIG1P18858 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIG1P18858 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIG1P18858 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIG1P18858 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIG1P18858 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIG1P18858 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIG1P18858 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIG1P18858 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms