Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
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