Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB3P16520 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB3P16520 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB3P16520 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GNB3P16520 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB3P16520 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB3P16520 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB3P16520 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB3P16520 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB3P16520 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB3P16520 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB3P16520 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB3P16520 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB3P16520 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB3P16520 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB3P16520 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB3P16520 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB3P16520 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB3P16520 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB3P16520 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB3P16520 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB3P16520 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB3P16520 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB3P16520 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB3P16520 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB3P16520 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB3P16520 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB3P16520 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB3P16520 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB3P16520 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB3P16520 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB3P16520 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB3P16520 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB3P16520 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GNB3P16520 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GNB3P16520 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB3P16520 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB3P16520 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB3P16520 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB3P16520 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB3P16520 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB3P16520 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB3P16520 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB3P16520 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB3P16520 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB3P16520 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB3P16520 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB3P16520 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB3P16520 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB3P16520 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB3P16520 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB3P16520 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB3P16520 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB3P16520 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB3P16520 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB3P16520 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB3P16520 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB3P16520 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB3P16520 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNB3P16520 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB3P16520 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms