Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRAFP15056 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRAFP15056 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRAFP15056 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRAFP15056 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRAFP15056 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRAFP15056 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRAFP15056 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRAFP15056 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRAFP15056 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRAFP15056 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRAFP15056 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRAFP15056 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRAFP15056 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRAFP15056 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRAFP15056 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRAFP15056 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRAFP15056 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRAFP15056 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRAFP15056 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRAFP15056 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRAFP15056 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BRAFP15056 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRAFP15056 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRAFP15056 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRAFP15056 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRAFP15056 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRAFP15056 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRAFP15056 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRAFP15056 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRAFP15056 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRAFP15056 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRAFP15056 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRAFP15056 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRAFP15056 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRAFP15056 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRAFP15056 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BRAFP15056 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRAFP15056 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRAFP15056 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRAFP15056 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRAFP15056 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRAFP15056 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRAFP15056 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRAFP15056 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRAFP15056 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRAFP15056 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRAFP15056 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRAFP15056 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRAFP15056 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRAFP15056 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRAFP15056 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
BRAFP15056 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BRAFP15056 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRAFP15056 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRAFP15056 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRAFP15056 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRAFP15056 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRAFP15056 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRAFP15056 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRAFP15056 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRAFP15056 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRAFP15056 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRAFP15056 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BRAFP15056 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms