Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LYL1P12980 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LYL1P12980 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYL1P12980 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYL1P12980 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYL1P12980 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYL1P12980 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYL1P12980 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYL1P12980 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYL1P12980 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LYL1P12980 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LYL1P12980 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYL1P12980 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYL1P12980 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYL1P12980 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYL1P12980 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYL1P12980 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LYL1P12980 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYL1P12980 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYL1P12980 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYL1P12980 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYL1P12980 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYL1P12980 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYL1P12980 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYL1P12980 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LYL1P12980 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms