Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP1P11387 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP1P11387 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP1P11387 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP1P11387 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP1P11387 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOP1P11387 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1P11387 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1P11387 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1P11387 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1P11387 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1P11387 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1P11387 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1P11387 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1P11387 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1P11387 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1P11387 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1P11387 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1P11387 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1P11387 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1P11387 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1P11387 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1P11387 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1P11387 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1P11387 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1P11387 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1P11387 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1P11387 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1P11387 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1P11387 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1P11387 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1P11387 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1P11387 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1P11387 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1P11387 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1P11387 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP1P11387 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1P11387 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1P11387 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1P11387 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1P11387 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1P11387 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1P11387 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1P11387 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1P11387 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1P11387 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1P11387 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1P11387 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1P11387 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1P11387 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1P11387 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1P11387 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1P11387 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1P11387 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1P11387 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1P11387 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1P11387 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1P11387 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1P11387 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1P11387 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1P11387 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1P11387 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1P11387 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1P11387 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1P11387 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1P11387 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1P11387 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1P11387 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1P11387 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1P11387 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1P11387 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1P11387 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1P11387 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1P11387 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1P11387 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1P11387 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1P11387 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1P11387 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1P11387 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1P11387 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1P11387 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1P11387 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1P11387 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP1P11387 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP1P11387 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP1P11387 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP1P11387 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP1P11387 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP1P11387 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP1P11387 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP1P11387 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP1P11387 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP1P11387 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP1P11387 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP1P11387 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP1P11387 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TOP1P11387 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TOP1P11387 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1P11387 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1P11387 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms