Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NR2F1P10589 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms