Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HKR1P10072 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HKR1P10072 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HKR1P10072 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HKR1P10072 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HKR1P10072 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HKR1P10072 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HKR1P10072 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HKR1P10072 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HKR1P10072 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HKR1P10072 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HKR1P10072 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HKR1P10072 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HKR1P10072 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HKR1P10072 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HKR1P10072 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HKR1P10072 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HKR1P10072 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HKR1P10072 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HKR1P10072 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HKR1P10072 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HKR1P10072 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HKR1P10072 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HKR1P10072 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HKR1P10072 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HKR1P10072 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HKR1P10072 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HKR1P10072 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HKR1P10072 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HKR1P10072 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HKR1P10072 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HKR1P10072 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HKR1P10072 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HKR1P10072 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HKR1P10072 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HKR1P10072 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HKR1P10072 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HKR1P10072 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HKR1P10072 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HKR1P10072 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HKR1P10072 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HKR1P10072 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HKR1P10072 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HKR1P10072 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HKR1P10072 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HKR1P10072 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HKR1P10072 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HKR1P10072 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HKR1P10072 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HKR1P10072 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HKR1P10072 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HKR1P10072 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HKR1P10072 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HKR1P10072 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HKR1P10072 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HKR1P10072 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HKR1P10072 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HKR1P10072 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HKR1P10072 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HKR1P10072 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HKR1P10072 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HKR1P10072 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HKR1P10072 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HKR1P10072 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HKR1P10072 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HKR1P10072 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HKR1P10072 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HKR1P10072 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HKR1P10072 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HKR1P10072 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HKR1P10072 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HKR1P10072 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HKR1P10072 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HKR1P10072 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HKR1P10072 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HKR1P10072 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HKR1P10072 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HKR1P10072 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HKR1P10072 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HKR1P10072 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HKR1P10072 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HKR1P10072 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HKR1P10072 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HKR1P10072 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HKR1P10072 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HKR1P10072 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HKR1P10072 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HKR1P10072 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HKR1P10072 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HKR1P10072 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HKR1P10072 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HKR1P10072 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HKR1P10072 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HKR1P10072 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HKR1P10072 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HKR1P10072 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HKR1P10072 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HKR1P10072 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms