Protein–RNA interactions for Protein: P09341

CXCL1, Growth-regulated alpha protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL1P09341 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL1P09341 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL1P09341 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL1P09341 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL1P09341 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CXCL1P09341 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL1P09341 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL1P09341 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL1P09341 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL1P09341 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL1P09341 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL1P09341 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL1P09341 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL1P09341 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL1P09341 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CXCL1P09341 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL1P09341 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL1P09341 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL1P09341 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL1P09341 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL1P09341 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL1P09341 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL1P09341 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL1P09341 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CXCL1P09341 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CXCL1P09341 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CXCL1P09341 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms