Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CENPBP07199 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CENPBP07199 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CENPBP07199 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CENPBP07199 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CENPBP07199 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CENPBP07199 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CENPBP07199 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CENPBP07199 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CENPBP07199 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CENPBP07199 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPBP07199 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPBP07199 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPBP07199 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPBP07199 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPBP07199 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPBP07199 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPBP07199 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPBP07199 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPBP07199 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPBP07199 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPBP07199 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPBP07199 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPBP07199 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPBP07199 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPBP07199 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPBP07199 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPBP07199 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPBP07199 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPBP07199 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPBP07199 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPBP07199 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPBP07199 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPBP07199 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPBP07199 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPBP07199 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPBP07199 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPBP07199 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPBP07199 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPBP07199 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPBP07199 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPBP07199 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPBP07199 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPBP07199 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPBP07199 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPBP07199 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPBP07199 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPBP07199 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPBP07199 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPBP07199 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPBP07199 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPBP07199 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPBP07199 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPBP07199 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPBP07199 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPBP07199 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPBP07199 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPBP07199 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPBP07199 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPBP07199 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPBP07199 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPBP07199 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPBP07199 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPBP07199 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPBP07199 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPBP07199 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPBP07199 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPBP07199 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPBP07199 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPBP07199 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPBP07199 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPBP07199 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPBP07199 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPBP07199 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPBP07199 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPBP07199 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPBP07199 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPBP07199 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPBP07199 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPBP07199 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPBP07199 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPBP07199 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPBP07199 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPBP07199 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPBP07199 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPBP07199 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPBP07199 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPBP07199 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPBP07199 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPBP07199 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPBP07199 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPBP07199 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPBP07199 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPBP07199 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPBP07199 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CENPBP07199 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CENPBP07199 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CENPBP07199 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CENPBP07199 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CENPBP07199 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms