Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DOAP06340 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DOAP06340 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DOAP06340 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DOAP06340 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DOAP06340 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DOAP06340 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DOAP06340 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HLA-DOAP06340 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DOAP06340 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms