Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKV1-17P01599 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKV1-17P01599 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms