Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYF2O95926 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYF2O95926 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYF2O95926 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYF2O95926 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYF2O95926 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYF2O95926 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYF2O95926 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYF2O95926 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYF2O95926 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYF2O95926 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SYF2O95926 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYF2O95926 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYF2O95926 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYF2O95926 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYF2O95926 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYF2O95926 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYF2O95926 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYF2O95926 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYF2O95926 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYF2O95926 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYF2O95926 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYF2O95926 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYF2O95926 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYF2O95926 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYF2O95926 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYF2O95926 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYF2O95926 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYF2O95926 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SYF2O95926 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYF2O95926 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYF2O95926 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYF2O95926 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYF2O95926 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYF2O95926 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYF2O95926 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYF2O95926 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYF2O95926 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYF2O95926 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYF2O95926 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYF2O95926 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYF2O95926 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYF2O95926 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYF2O95926 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYF2O95926 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYF2O95926 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYF2O95926 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYF2O95926 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYF2O95926 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYF2O95926 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYF2O95926 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYF2O95926 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYF2O95926 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYF2O95926 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYF2O95926 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYF2O95926 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYF2O95926 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYF2O95926 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYF2O95926 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYF2O95926 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYF2O95926 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYF2O95926 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYF2O95926 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYF2O95926 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYF2O95926 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYF2O95926 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYF2O95926 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYF2O95926 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYF2O95926 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SYF2O95926 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYF2O95926 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYF2O95926 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYF2O95926 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms