Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABARAPO95166 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms