Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCN2BO60939 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms